Hola Entiendo que puedes enviar una copia de los correos enviados a la carpeta local, pero los mensajes recibidos estarán en la carpeta correspondiente de cada cuenta, y esto es así porque están sincronizadas con el servidor, mas información de las configuraciones que puedes realizar en los siguientes enlaces: https://support.mozilla.org/es/kb/opciones-de-configuracin-de-cuentas https://support.mozilla.org/es/kb/mensajes-archivados Saludos

Pero eso no es lo que busco, las cuentas pop si se puede poner en carpetas locales, porqué las imap no?

Hola, Las carpetas de las cuenta imap se sincroniza con las carpetas del servidor, podes agregar, borrar o no sincronizar pero sigue siendo como una copia del servidor, los correos están en el servidor, si puedes unirlas en servidor los veras en el Thunderbird, por ejemplo en gmail podes recibir correos de otra cuenta.

En cambio en POP3 los correos se descargan en el TB, No están en el servidor, por lo tanto puedes hacer lo que quieras.

Saludos